در این بازدید طلاب با چهار بخش از کتابخانه آشنا شدند:
بخش اول بازدید از مخزن کتابخانه :
در این قسمت کتابهای خطی مولفان مشهور اسلامی جمع آوری شده است. تعداد نسخههاى خطى مجلد شصتهزار عنوان، مشتمل بر بيش از ٣١٠٠٠ با موضوعات مختلفی همچون فقه و اصول، کلام و عقايد، منطق و فلسفه، عرفان و تصوف، حديث، تفسير و علوم قرآن، ادبيات، اخلاق، طبيعيات، تراجم و رجال و درايه، انساب، علوم غريبه و اعد ادو.... میباشد.
این گنجینه نفیس با تلاش و زحمت فراون حضرت آیت الله مرعشی گرد آوری شده است،تعدادی ازکتابها از پدر بزرگوار ایشان به ارث رسیده است وبخشی دیگر در نجفاشرف با انجام نماز و روزه استيجارى ، حذف يک وعده غذاى روزانه خود و کار کردن شبانه در يک کارگاه برنجکوبى فراهم کردهاند؛بخش ديگر نیز از نخستين روز اقامت در قم تا آخرين روز حيات خود در طول هفتاد سال خريدارى نمودهاند، که بخش عمده اين گنجينه را تشکيل مىدهد؛ بخشى ديگر متولى کتابخانه به دستور پدر در سفرهاى بىشمار خود به شهرها و روستاهاى ايران در طول چهل سال جمع آوری شده و تعدادی هم به صورت هدیه و يا وقف به کتابخانه اهدا شده است.
بخش دوم مرمت وبازسازی کتب:
در این قسمت نسخههاى فرسوده و آسيبديده به روش سنتی یا دستگاههای پیشرفته ترميم و بازسازى مىشود.
بخش سوم مرکز میکرو گرافی:
مرکز میکرو گرافی یا فشرده سازی اطلاعات ابتدا از نسخههاى خطى ميکروفيلم به صورت ٣٥ ميلىمترى تهيه مىشود و از روى آن تصويربردارى مىکنند و پس از جلدسازى به صورت کپى از اصل در مىآيد.
اطلاعات و دادهها از ميکروفيلم ها بر روى ديسکت هاى رايانهاى با استفاده از اسکنر ويژه ی نسخههاى خطى در اختیار پژوهشگران قرار می گیرد.حتی کسانی که امکان حضور در کتابخانه را ندارند می توانند با دادن سفارش کپی از اطلاعات نسخه های خطی در یافت نمایند.
بخش چهارم بیمارستان کتاب:
در بیمارستان کتاب، کتابهای که به علت نگهداری نامناسب توسط کرمها و حشرات در معرض نابودی قرار گرفته اند به وسیله مواد مخصوصی گند زدایی میشوند و بعد ازمدتی نگهداری در شرایط مناسب مداوا و به قسمت ترمیم و بازسازی و سپس به مخزن کتاب انتقال داده می شوند